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Bladder EpiCheck® : l’épigénétique pour détecter avec précision la récidive du cancer de la vessie

Développé par Nucleix, une société de biotechnologie spécialisée dans la détection des cancers dans les biopsies liquides, Bladder EpiCheck® est un test urinaire conçu pour repérer la récidive de cancer de la vessie. Son fonctionnement, basé sur l’épigénétique, en fait un excellent allié des urologues dans la détection précoce et non invasive des signes de reprise de la maladie.

La technologie du test urinaire Bladder EpiCheck® est basée sur la recherche dans l’urine des anomalies des marqueurs épigénétiques que l’on retrouve assez précocement dans les cancers de la vessie. Depuis de nombreuses années déjà, Nucleix a acquis une grande expertise dans le champ de l’épigénétique et de la méthylation de gènes.

Une recherche de 15 marqueurs méthylés

Quatre bases constituent notre ADN. L’épigénétique agit sur l’une de ces bases, la cytosine, par une méthylation. Cette méthylation ne va pas entrainer une modification du cadre de lecture du gène comme le ferait une mutation, mais va jouer sur sa capacité à s’exprimer. « Le système de méthylation qui va réguler l’expression de ces gènes, fait apparaître des altérations dans les cellules que l’on appelle les altérations épigénétiques et qui sont assez précoces dans les phénomènes de transformation des cellules tumorales. Il y a donc un intérêt à regarder ces anomalies dans les phases précoces de la maladie car elles apportent un supplément d’information par rapport à d’autres tests basés sur les anomalies d’expression de certains gènes », explique le Dr Pierre-Jean Lamy, biologiste médical, onco-généticien et directeur scientifique du groupe de laboratoires de Biologie Médicale Inovie. Dans l’épigénétique, l’étude porte sur la vérification de la présence d’une anomalie structurelle épigénétique susceptible d’entrainer des effets de type hypo ou hyper expression altérant le fonctionnement des cellules cancéreuses. « Les anomalies épigénétiques démarrent très tôt dans l’histoire de la maladie, ce qui permet de détecter précocement le cancer. De plus, on étudie un signal et non une quantité, un facteur qualitatif plutôt que quantitatif et indépendant de plusieurs facteurs comme l’heure du prélèvement ou la quantité d’hydratation. Ce signal est donc très stable », précise le Dr Lamy. La solidité de ce mécanisme offre la possibilité de réaliser le test sans contrainte horaire ni de niveau d’hydratation. La recherche se fait sur 15 marqueurs méthylés. « Cela peut paraître beaucoup mais fournit un résultat plus fiable. La difficulté repose sur la capacité à correctement manier la technique pour détecter les anomalies épigénétiques », prévient l’onco-généticien. Le test a une très haute sensibilité. Lorsque l’on s’interroge sur la présence d’un cancer en phase précoce, l’épigénétique est donc un outil intéressant. Dans le cancer de la vessie, le fait de disposer d’un test également très spécifique dans les premiers temps du suivi de la maladie, contribue à réduire le nombre de cystoscopies de suivi et de faux positifs. Ainsi, la bonne sensibilité et spécificité de Bladder EpiCheck® permettent un diagnostic fiable et plus précoce de la récidive.

De la prescription aux résultats : un circuit simple

Le test Bladder EpiCheck® a récemment obtenu l’approbation de la FDA pour son utilisation dans le suivi des cancers de la vessie aux États-Unis. « En plus du marquage CE reçu en 2017, cette validation confirme l’existence de données contributives avec un recul suffisant », explique le Dr Thomas Duret, biologiste médical, directeur général du laboratoire Inovie Gen-Bio dans lequel seront réalisés l’ensemble des tests Bladder EpiCheck® en France. Intégrer cette cohorte prospective qu’est le Registre TVNIM-AFU confirmera l’intérêt du test dans le parcours de soins du patient. Il est important d’en connaître la faisabilité en temps réel et de voir comment les urologues vont se l’approprier ».

Sa prescription est simple, tout comme son utilisation. Les prélèvements d’urine se font soit au domicile des patients, soit dans leur laboratoire de proximité. « Nous avons un réseau important de 626 laboratoires en France avec des biologistes qui seront les ambassadeurs de ce test. Les urologues pourront les contacter via la liste de biologistes référents qui leur sera communiquée », détaille le spécialiste d’Inovie Gen-Bio. Les laboratoires se situent à la fois au sein des cliniques dans lesquelles exercent les urologues, mais également à proximité de celles-ci et en ville. Le parcours patient est extrêmement simple car pour effectuer le test Bladder EpiCheck®, aucune préparation avant le recueil de l’urine n’est nécessaire. Bladder EpiCheck® ne requiert pas d’hydratation minimum et peut être réalisé à tout moment de la journée. Une fois le test déposé dans l’un des 626 points de collecte des laboratoires du groupe Inovie, l’échantillon est ensuite transporté vers la plateforme Imagenome du laboratoire Gen-Bio (groupe Inovie) située à Clermont-Ferrand. L’urine doit être traitée dans les 5 jours afin d’assurer le maintien de la qualité de l’échantillon. C’est sur ce site que sera réalisée la technique de PCR sur les 15 marqueurs méthylés. Les résultats sont ensuite envoyés à l’urologue et une transmission est également effectuée aux attachés de recherche clinique pour que l’AFU soit informée en temps réel des retours d’examens.

Vanessa Avrillon

Logigramme de fonctionnement du test Bladder EpiCheck®

Documents et liens utiles

Tableau de performance de sensibilité et de spécificité du test Nucleix Bladder EpiCheck® et valeurs prédictives

	91%	74%	84%	98%
Performance du test	Sensibilité de haut grade	Sensibilité globale	Spécificité	Valeur Prédictive Négative pour les tumeurs de haut grade (VPN)
Qu’est-ce que cela signifie ?	Le pourcentage de tumeurs de haut grade détectées par le test	Le pourcentage de tumeurs détectées par le test, tous grades confondus	Le pourcentage de patients n’ayant pas de tumeurs correctement rapportés comme négatifs	Le pourcentage de chance qu’un résultat négatif soit réellement négatif pour un cancer de haut grade

Webinaire – Registre TVNIM-AFU & évaluation des biomarqueurs des tumeurs de vessie 2 – test Bladder Epicheck

Nucleix : une expertise dans les biopsies « liquides »

Fondée en 2008, basée à San Diego en Californie et à Rehovot en Israël, la société Nucleix s’appuie sur l’épigénétique et la méthylation de gènes pour développer des tests de détection précoce du cancer et de sa récidive. Les biopsies «liquides» réalisées sur le sang et l’urine des patients sont des outils puissants dans le diagnostic de la maladie. Le test Bladder EpiCheck® proposé par Nucleix est désormais disponible en France via le Registre TVNIM-AFU dans le cadre de la surveillance de la récidive des cancers de la vessie.

Le cancer de vessie est le cinquième cancer le plus répandu dans le monde occidental. On compte plus d’un million de patients atteints en Europe et plus de 700 000 aux États-Unis. 70 à 80 % d’entre eux sont diagnostiqués avec une maladie non invasive sur le plan musculaire. En raison du taux élevé de récidive, les patients atteints de tumeur de la vessie n’infiltrant pas le muscle nécessitent jusqu’à quatre visites de suivi chaque année. Ces visites s’accompagnent de cystoscopies invasives et douloureuses, négatives dans 90 % des cas et ne détectant que 70 à 80 % des récidives. « La cystoscopie, tout comme la cytologie urinaire, est subjective, désagréable pour le patient et très coûteuse pour le système de santé, constate Ricardo A.J. ten Velden, Vice-Président des Ventes et du Marketing chez Nucleix. Compte tenu de ces éléments, il existe un besoin évident, non satisfait, de proposer un test non invasif, objectif, sensible et spécifique pour aider les urologues et les patients dans la surveillance des TVNIM. Nucleix a investi ce champ de la recherche en concevant un outil répondant à ces attentes ».

Les domaines de recherche de Nucleix

Les biopsies « liquides » offrent une alternative non invasive aux tests diagnostiques effectués sur les tissus. L’interprétation de leurs résultats est indépendante de la compétence humaine. Ainsi, Nucleix s’est intéressé à la détection des tumeurs de la vessie n’infiltrant pas le muscle (TVNIM). Ses travaux ont abouti à la mise sur le marché de Nucleix Bladder EpiCheck®, un outil fournissant aux patients et aux cliniciens un test urinaire simple et objectif, capable de repérer la récurrence des TVNIM. « Le test analyse les altérations épigénétiques spécifiques à la maladie sur 15 marqueurs de méthylation de l’ADN associés au cancer de la vessie. Nucleix Bladder EpiCheck® a été conçu pour détecter les cancers de la vessie et les cancers urothéliaux des voies supérieures », explique le Dr Aharona Shuali, Vice-Présidente des Affaires Médicales chez Nucleix. Concrètement, l’ADN est extrait des cellules sédimentaires dans l’urine, traité avec des enzymes spéciales puis testé au moyen d’une PCR, fournissant ainsi une information sur chacun des 15 biomarqueurs de méthylation du test. Ces informations sont ensuite analysées par un logiciel qui produit un résultat de test positif / négatif objectif avec des classifications numériques supplémentaires allant de 0 à 100.

Le processus de mise sur le marché

Nucleix Bladder EpiCheck® a reçu en mars 2017 l’approbation du marquage CE pour une utilisation associée à la cystoscopie dans la détection non invasive de la récidive tumorale chez les patients précédemment diagnostiqués d’un cancer de la vessie. Cette approbation a récemment été étendue pour inclure également l’aide à la détection des cancers primitifs de la vessie et des carcinomes urothéliaux des voies supérieures chez les patients présentant une hématurie et/ou d’autres symptômes des voies urinaires et/ou des signes suspects de malignité. « En mai 2023, Nucleix a également reçu l’autorisation de la Food and Drug Administration (FDA) pour commercialiser Bladder EpiCheck® aux États-Unis comme méthode non invasive de surveillance de la récidive tumorale chez les patients précédemment diagnostiqués d’une tumeur de la vessie n’infiltrant pas le muscle, en association avec la cystoscopie, ajoute Ricardo A.J. ten Velden. Il s’agit du premier test urinaire basé sur la méthylation réalisée sur une plate-forme PCR à recevoir l’autorisation de la FDA ».

Des études en faveur de la performance

Dans une méta-analyse indépendante de cinq études prospectives incluant 1684 patients atteints de TVNIM, Nucleix Bladder EpiCheck® a prouvé ses excellentes performances par rapport aux autres tests urinaires avec une sensibilité de 74 %, une sensibilité de 91 % sur les tumeurs de haut grade et une spécificité de 84 %. La probabilité d’un vrai négatif pour une maladie de haut grade a été estimée à 98 % excluant ainsi la maladie de haut grade avec une confiance élevée tout en permettant d’éviter jusqu’à 84 % des bilans de récidive. À la suite des dix études publiées par différents centres européens et du fait des bons résultats obtenus, Bladder EpiCheck® a été inclus en 2022 dans les directives de l’EAU. Le produit est d’ores et déjà utilisé dans la prise de décision clinique dans divers pays européens comme l’Italie, l’Espagne ou les Pays-Bas (Cf. 3 vidéos ci-dessous). « En plus de Bladder EpiCheck®, Nucleix développe actuellement Lung EpiCheck®, un test pour la détection précoce du cancer du poumon chez les patients avec des antécédents de tabagisme », informe le Dr Aharona Shuali. « La société Nucleix envisage de poursuivre ses efforts de recherche avec l’objectif de concevoir de nouveaux tests basés sur des biopsies « liquides » et destinés au dépistage de nombreux autres types de cancers ».

Vanessa Avrillon

Pour connaître la procédure à suivre permettant de proposer Nucleix Bladder EpiCheck® à vos patients, contactez Inovie : https://inovie.fr/

Numéros réservés aux urologues : 04 63 05 75 32 / 04 63 05 05 63

Tableau de performance du test

	91%	74%	84%	98%
Performance du test	Sensibilité de haut grade	Sensibilité globale	Spécificité	Valeur Prédictive Négative pour les tumeurs de haut grade (VPN)
Qu’est-ce que cela signifie ?	Le pourcentage de tumeurs de haut grade détectées par le test	Le pourcentage de tumeurs détectées par le test, tous grades confondus	Le pourcentage de patients n’ayant pas de tumeurs correctement rapportés comme négatifs	Le pourcentage de chance qu’un résultat négatif soit réellement négatif pour un cancer de haut grade