ETUDE DU PROFIL GENOMIQUE DES TUMEURS SUPERFICIELLES DE VESSIE PAR ANALYSE DES PUCES A OLIGONUCLEOTIDES (U133A) ET CORRELATION A LA REPONSE AU BACILLE DE CALMETTE-GUERIN : VERS UNE PHARMACOGENOMIQUE DES TUMEURS SUPERFICIELLES DE VESSIE ?
Objectifs : Etudier l’expression des gènes des tumeurs superficielles de vessie avant BCG, identifier leur sur- ou sous-expression, et la corréler à la réponse thérapeutique au BCG.
Méthodes. Analyse génomique (22283 gènes) par puce à oligonucléotides (Affymetrix ; U133A) d’une cohorte de 20 patients, traités par BCG, après résection endoscopique complète d’une première tumeur superficielle de vessie (pTa, pT1, ou Carcinome in situ) diagnostiquée entre 1990 et 2001. L’âge moyen des patients était de 69 ans (58-79). Le schéma d’instillations était composé par 6 instillations de BCG Pasteur (n=6 ; 1990-1996) ou de BCG Immucyst (14 ; 1996-2001). L’analyse des gènes susceptibles de différencier les patients répondeurs des patients non répondeurs au BCG, était réalisée par les systèmes MAS 5.0 et Genespring et la hiérarchisation tumorale par Bootstrapping.
Résultats : La médiane de suivi était de 52 mois (16-88). Le délai moyen de récidive était de 24.7 mois (4-49). 13 patients n’ont pas présenté de récidive, 6 ont récidivé et 1 patient a progressé. En utilisant un t-test et en considérant une valeur p<0.05 significative, nous avons isolé 37 gènes capables de différencier les répondeurs (REP) des non répondeurs (NREP) (gènes codant la production d’interféron, gènes impliqués dans la signalisation intracellulaire (TGF-beta), gènes codant les protéines de la famille de la Synaptotagmine, et gènes codant les chemokines et leurs récepteurs (CCR)). La hiérarchisation tumorale était capable d’isoler les patients ne présentant pas de récidive après plus de 4 ans de suivi.
Conclusions: L’analyse du profil génomique tumoral a permis l’identification de nouveaux gènes permettant de sélectionner les patients susceptibles de répondre au BCG.