Recherche de marqueurs d’hyperplasie bénigne de prostate par étude combinée d’Expression Arrays et de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) Arrays
Introduction : Le mécanisme moléculaire de l’hyperplasie bénigne de prostate (HBP) est encore mal connu. Nous avons recherche la signature moléculaire de l’HBP à l’aide de deux nouvelles technologies, les expressions arrays et les SNP arrays. Les expressions arrays analysent les niveaux d’expression des gènes sur des micropuces. Les SNP arrays sont des micropuces qui explorent le polymorphisme nucléotidique de l’ADN chromosomique. Ils permettent ainsi de déterminer les 2 allèles situes sur chaque paire chromosome au niveau de 11000 sites repartis sur l’ensemble du génome. Ces sites, appelés SNP, sont connus pour leur variabilité au sein d’une population normale d’individus.
Méthode : un premier groupe d’échantillon (17 HBP et 9 prostates normales) a été utilise sur des expressions arrays interrogeants les niveaux d’expression génique de 20002 gènes. Un second groupe de 19 échantillons (7 HBP et 12 prostates normales) a été utilisé sur les SNP arrays. Les deux sources de résultats ont été confrontées.
Résultats : L’expression génique de l’HBP est parfaitement distinguable de la prostate normale. Les anomalies chromosomiques associées à l’HBP sont rares, en particulier, aucun génotype spécifique ni aucune perte d’hétérozygotie n’a été mis en évidence. Malgré l’absence de large région d’amplification chromosomique, de courtes amplifications ont été suspectées. Certaines de ces amplifications étaient localisées sur des gènes hyper exprimés dans l’HBP lors de l’analyse par expression arrays, parmi lesquels Nell2, EDG-3, PMP22 et BRMS1.
Conclusion : Nous rapportons la première étude combinée d’expressions arrays et de SNP arrays sur l’HBP. Des marqueurs d’HBP ont été suspectés, ainsi que certains mécanismes moléculaires d’amplifications chromosomiques.
SUBVENTIONNE PAR L’Association pour la Recherche sur les Tumeurs de Prostate