Objectifs.– Effectuer une revue de la littérature concernant les polymorphismes simples pour un nucléotide (SNP) associés au cancer de la prostate (CaP), en individualisant les données entre les populations d’origine européenne, africaine et asiatique.

Méthodes.– Une revue systématique de la littérature a été effectuée sur la base de données Medline/Pubmed, en utilisant les mots-clés prostate cancer associé à genome wide, GWAS, SNP, polymorphism, association study ou replication. Cette revue incluait tous les articles publiés jusqu’à mars 2012, sans limite de type de journal ou de langue. Les articles ont été triés sur la base de leur abstract et classés comme étude d’association du génome entier a plusieurs étapes (multistage GWAS), étude de réplication ou étude de localisation (fine mapping), ou exclues. Un SNP était considéré comme significativement associé au CaP en cas d’association avec p < 5,10^?8. Pour chaque locus de susceptibilité avec multiples SNP associés, une étude du déséquilibre de liaison (LD) entre tous les SNP du locus a été menée (en utilisant les données publique des projets HapMap et 1000Genomes. En cas de LD élevée (r² > 0,8), les SNP avec le p le plus faible était sélectionné comme représentant le locus.

Résultat.– Quarante-huit SNP indépendants ont été décrits comme associés au CaP dans la littérature, représentant 40 loci différents. Trente-neuf SNPs ont été découverts chez des patients d’origine européenne, un en population d’origine africaine et huit en population d’origine asiatique. Quatre, dix et 22 SNPs n’ont jamais été testés dans les populations respectivement européenne, africaine et asiatique. Seul 15 locus peuvent être considérés comme ubiquitaires. La plupart des études de réplications manquaient de puissance.

Conclusion.– Un effort de recherche considérable a permis de découvrir en cinq ans 48 SNPs prédisposant au CaP. Cependant, ces données sont encore très inégalement réparties entre les différentes ethnies, et de plus amples investigations sont nécessaires dans les populations non européennes.

Type de financement.– Bourse de mobilité AFU 2011 – Pierre Fabre.